Widoczne bez użycia mikroskopu skupisko mikroorganizmów, które powstało z jednej komórki na płytce z podłożem hodowlanym, to

Kolonia drobnoustrojów to zbiorowisko komórek, które wyrosło z jednej pojedynczej komórki na odpowiedniej pożywce hodowlanej. Każda kolonia jest wizualnie wyodrębniona, co umożliwia łatwe ich zaobserwowanie gołym okiem. W kontekście mikrobiologii, kolonie drobnoustrojów są niezwykle istotne, ponieważ pozwalają na identyfikację różnych gatunków bakterii oraz ocenę ich liczby w próbkach. Przykładem zastosowania jest hodowla bakterii w diagnostyce medycznej, gdzie kolonii używa się do wyizolowania patogenów odpowiedzialnych za infekcje. Dobrą praktyką jest stosowanie metod takich jak rozcieńczanie próbki oraz inokulacja na różnych rodzajach pożywek, co pozwala na uzyskanie czystych kolonii ułatwiających dalsze analizy. Istotne jest również, aby pamiętać, że kolonie mogą różnić się wyglądem, kształtem oraz kolorami w zależności od gatunku drobnoustrojów oraz zastosowanej pożywki, co jest pomocne w ich wstępnej identyfikacji.